斯基拉奇在1990年世界杯中第一次代表国家队亮相，他在意大利队首场对阵奥地利队的比赛中替补安德烈亚·卡尔内瓦莱出场并打入制胜一球，帮助球队以1-0获胜。在对阵美国队的比赛中，斯基拉奇再次替补出场。
第三场迎战捷克斯洛伐克中，斯基拉奇与罗伯特·巴乔一道入选首发阵容。二人各入一球，比赛最终以2-0收场。8分之一决赛和四分之一决赛分别对阵乌拉圭和爱尔兰的比赛中，斯基拉奇都为本队打入了制胜一球。
半决赛遭遇马拉多纳率领的阿根廷队的比赛中， 维亚利代替巴乔与斯基拉奇搭档首发。斯基拉奇先入一球，卡尼吉亚下半场将比分扳平，90分钟双方打成1-1。阿根廷队最终在点球大战中胜出。
三四名决赛挑战英格兰队的比赛中，斯基拉奇与巴乔搭档锋线。巴乔先入一球，斯基拉奇点球再将比分改写。意大利队终以2-1取胜，斯基拉奇也以6粒入球荣获本届世界杯金靴奖。[3] 斯基拉奇共为国家队出场16次，打入7球。1991年对阵挪威队的比赛中，他打入了自己在国际赛事中的最后一球。[4]
1990年世界杯仍被意大利球迷亲切地称为“Notti Magiche di Totò Schillaci”（托托·斯基拉奇的奇妙之夜）， [5] 儘管他们的球队未能在本土捧杯，隨後斯基拉奇因受傷等原因狀態迅速滑落，1991年後未曾入選國家隊，含7場進6球的1990世界盃在內，只有留下16場進7球的紀錄。